شكل تسليم السلطات التونسية آخر رئيس وزراء في عهد القذافي البغدادي المحمودي إلى طرابلس أزمة سياسية حقيقية في تونس إذ هدد الرئيس التونسي منصف المرزوقي بالإستقالة من منصبه على خلفية هذه القضية.
واعتبر المرزوقي أن توقيع رئيس الحكومة على أمر التسليم يعتبر خرقا واضحا لالتزامات تونس الدولية وتجاه الأمم المتحدة، فيما دعا أعضاء المجلس التأسيسي إلى البت في هذه المسألة بعدما تجاوزت الحكومة صلاحياتها، وفق تعبيره.
وكان الرئيس المرزوقي قد عبر عن معارضته لتسليم المحمودي، إلا بعد التأكد من توفر ضمانات بخضوعة لمحاكمة عادلة
